Comme mon zoom se comporte idem sur deux autres boîtiers (D3 et aussi D700), je dirais que dans mon cas cela vient de l'objectif. Ceci dit, c'est assez rare, disons une fois sur 20.
Je n'ai rien remarqué avec d'autres objectifs mais je me souviens avoir eu ce problème avec un 80-200 AF-D sur D2x.
(ça doit être dans les gènes...

)
Et pour toi, tu as remarque un cas pareil sur ton boîtier avec d'autres objectifs?