Analyser ou interpréter mes observations ?

Démarré par Berzou, Janvier 22, 2021, 08:06:01

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Berzou

J'aimerai avoir quelques pistes pour analyser ou interpréter mes observations

Je m'explique :

J'ai chargé mes onservations de 2020 sur faune paca, et je contribue ainsi par exemple à la liste communale des espèces
J'ai chargé presque toutes mes observations sur iNaturalist depuis 2008 surtout depuis 2014
Voir mes inventaires naturalistes https://sites.google.com/view/passionphoto/accueil/inventaires plus de 3000 observations et plus de 1100 espèces vivantes

J'ai alimenté une page de trouvailles étonnantes ]https://sites.google.com/view/passionphoto/macro-photographie/jardin-garden/etonnant[url]
Il reste bien sûr des observations à identifier plus finement si possible
et je continuerai au fur et à mesure de mes observations

Maintenant j'aimerai en quelques sortes valoriser encore plus cette information.

Quelques idées :
- Participer à des projets sur iNaturalist
- Comparer mes observations à celles des environs
- Insister sur le lien entre les plantes et les insectes ou les interactions micro écosystèmes  (dans le genre écosystèmes de la branche de genêt qui pend devant la porte du garage
- Comparer mes observations au fil des années  (pour mon ancien jardin en Essonne )

Je suis preneur d'autres idées, les plus simples étant sûrement les plus réalistes ???
Je ne sais pas non plus ou proposer ces analyses car ça sort de l'objet de chasseurs d'images, peut être ouvrir un blog sur iNaturalist ?

caydou82

Un peu à côté du sujet, mais pour toi, tu peux voir la constance d'une espèce au fil des ans.
Je m'explique : telle espèce est signalée tous les ans, tous les 5 ans, tous les 10 ans, ...
tu peux aussi voir la fréquence de tel animal ; tous les jours, toutes les semaines, chaque année, ...

Je n'ai pas connaissance de site généraliste effectuant un suivi des animaux, mais cela existe probablement.
Par contre les différents associations font ce suivi au niveau de l'ordre (odonates, ...).

Je ne sais si cela te conviendra, mais c'est peut-être une piste intéressante.

Cordialement.
Bernard.

Berzou

Merci Caydou,
C'est bien dans le sujet. ..à suivre
J'ai déjà repéré certaines bestioles qui se retrouvent au même endroit au fil du temps

Xavier Corteel

La permanence ou non d'une même espèce, ses dates de présence, l'importance et la variation de sa population, le ou les milieux qu'elle fréquente, sa reproduction éventuelle, bref tout ce qui peut correspondre à une monographie d'un sujet particulier. Evidemment, les spécialistes ont déjà pour beaucoup d'espèces les informations correspondantes mais les confirmer, les compléter ou ou les faire évoluer c'est faire œuvre scientifique. Un tel projet demande un suivi des espèces que tu connais déjà et c'est peut-être pour toi un moindre centre d'intérêt que la recherche d'espèces nouvelles.
Curieux de Nature

Berzou

C'est bien ma demande,  analyser l'historique,  ça n'empêche pas de rechercher des espèces nouvelles, mais ça enrichit la compréhension des espèces déjà observées.
Mais en supposant,  avec mes compétences de néophyte , que je pose une hypothèse d'analyse sur une espèce observée,  où puis la proposer en validation ?

Xavier Corteel

Il faut une grosse collecte de données pour pouvoir valider une hypothèse à valeur scientifique, et les analyser est affaire de spécialistes, statisticiens en particulier. Comme caydou82, je pense que tu devrais poser le problème dans l'autre sens, à savoir te renseigner sur les programmes existants et proposer d'y participer. Les associations ne manquent pas qui s'intéressent aux différents ordres qui figurent dans ta banque d'observations. A tout hasard, pour en connaître un membre actif, je te signale l'existence dans un département méditerranéen comme le tien, une Société d'Histoire naturelle multidisciplinaire (https://s2hnh.org/) mais je suppose que tu fréquentes déjà des chapelles de ce genre.
Curieux de Nature

daguet

La difficulté que je vois  dans ta présentation, se sont les 3000 obs pour 1100 espèces...une moyenne de 3 obs par espèce.
Je ne sais pas ce que l'on peut en extraire ?

3000 obs par espèce aurait été un base plus solide ;)

Berzou

Bonne remarque,
Au départ,  je n'archivais qu'une ou deux observations par espèce
Puis une par site,
J'ai élargi ma logique en reprenant presque toutes mes observations identifiables
Mais à la capture aussi j'ai fait naturellement un tri,
Mais en supposant qu'a partir de maintenant je photographie toutes les abeilles que je vois dans mon jardin,
Qu'est ce que je pourrais en faire...?

Même question pour les oiseaux du jardin, par exemple, d'ailleurs faune paca permet de saisir sans photo ses observations quotidiens des oiseaux du jardin...

Berzou

J'ai d'ailleurs pensé à élargir mon périmètre en intégrant mes observations dans des listes communales ou départementales
Pour me moment,  sur iNaturalist en France il n'y a pas encore assez de contributions,
Et on dépend aussi de la présence d'experts ...
Mais déjà je peux voir que dans mon jardin, j'ai pratiquement observé en quelques annees tout ce qui a pu être observé dans la ville (environnement urbain plutôt homogène
Ce n'est pas vrai ici dans le Var.
à suivre
Merci de vos remarques

Berzou

Citation de: daguet le Janvier 23, 2021, 15:20:32
La difficulté que je vois  dans ta présentation, se sont les 3000 obs pour 1100 espèces...une moyenne de 3 obs par espèce.
Je ne sais pas ce que l'on peut en extraire ?

3000 obs par espèce aurait été un base plus solide ;)

Ça,  ça sera l'oeuvre collective,  en espérant que de nombreux observateurs viendront contribuer, et ne se contenteront pas de quelques observations exceptionnelles

Par exemple observer l'évolution de l'aire de répartition d'une espèce au fil des années
Et pour les migrant,  les dates d'arrivée et de départ. (Les stats de dates d'observations par espece sont fournies en standard par iNaturalist,  mais tous lieux confondus...)

caydou82

Berzou,

Bien que je suis certain que tu les connaisses et que tu participes à leur travail visant à cerner la biodiversité, as-tu contacté les organismes suivants :

https://inpn.mnhn.fr/accueil/index
http://noe.org/
http://www.vigienature.fr/

Il en existe certainement d'autres.

L'inpn pourrait certainement t'aider.

Bernard.

Berzou

Merci pour ces pistes, que je vais emprunter avec ma lance de Don Quichotte :D :D

à petit pas....

je viens d'arriver à 4000 observations sur iNaturalist

Berzou

Citation de: Berzou le Janvier 22, 2021, 08:06:01
...
J'ai chargé presque toutes mes observations sur iNaturalist depuis 2008 surtout depuis 2014
Voir mes inventaires naturalistes https://sites.google.com/view/passionphoto/accueil/inventaires plus de 3000 observations et plus de 1100 espèces vivantes

...

je viens de passer les 10000 observations et 1560 espèces vivantes (au sens large)
https://www.inaturalist.org/observations?place_id=any&user_id=berzou&verifiable=any

ce qui fait plus de 400 nouvelles espèces cette année


Berzou

#13
Pour comptabiliser les espèces stricto sensu de mon jardin j'ai créé un projet sur inaturalist "Un jardin vivant à Sollies toucas"

https://www.inaturalist.org/projects/un-jardin-vivant-a-sollies-toucas

j'y ai observé en 2 ans
999 espèces lato sensu
756 stricto sensu c'est à dire identifiées au niveau de l'espèce
Citation de: coval95 le Octobre 26, 2021, 15:54:13
Quand tu dis que c'est le contraire, je comprends que tu as fait plus d'observations nouvelles en 2021 qu'en 2020.

au 27 oct 2020  j'avais cumulé 1872 observations dans ce jardin, et identifié 494 espèces animales  (lato sensu  - en incluant les familles sous familles...)

https://www.inaturalist.org/observations?d2=2020-10-27&nelat=43.24020042504075&nelng=6.038097422470656&place_id=any&project_id=un-jardin-vivant-a-sollies-toucas&subview=table&swlat=43.17923457617866&swlng=5.929087467763701&taxon_id=1&verifiable=any&view=species

du 28 octobre 2020 à aujourd'hui 27 octobre 2021 (donc en 1 an jour pour jour) j'ai observé 740 espèces animales en 4530 observations
https://www.inaturalist.org/observations?d1=2020-10-28&d2=2021-10-27&nelat=43.24020042504075&nelng=6.038097422470656&place_id=any&project_id=un-jardin-vivant-a-sollies-toucas&subview=table&swlat=43.17923457617866&swlng=5.929087467763701&taxon_id=1&verifiable=any&view=species

et depuis mon arrivée ici jusqu'à aujourd'hui  889 espèces animales en 6402 observations

https://www.inaturalist.org/observations?d1=2018-10-31&d2=2021-10-27&nelat=43.24020042504075&nelng=6.038097422470656&place_id=any&project_id=un-jardin-vivant-a-sollies-toucas&subview=table&swlat=43.17923457617866&swlng=5.929087467763701&taxon_id=1&verifiable=any&view=species

et par différence on peut en déduire que la deuxième année, j'ai observé 889 - 494 = 395 espèces animales nouvelles dans ce jardin que je n'avais pas observées la première année

Berzou

quand aux espèces nouvelles animales que j'ai pu observer en tous lieux

au 27 octobre 2019 j'en étais à  696 espèces lato sensu

au  27 octobre 2020                1022 espèces

au 27 octobre 2021                 1 316 espèces

.
je vais étudier les requêtes iNaturlaist pour voir si je peux obtenir les mêmes chiffres stricto sensu) cad  limitées à l'espèce ou au genre

Berzou

Citation de: Berzou le Octobre 27, 2021, 09:20:27
quand aux espèces nouvelles animales que j'ai pu observer en tous lieux

....
je vais étudier les requêtes iNaturlaist pour voir si je peux obtenir les mêmes chiffres stricto sensu) cad  limitées à l'espèce ou au genre

ca y est j'ai trouvé

         au 27/10/2019     660 genres ou espèces    dont 532 espèces (ou sous espèces)

         au 27/10/2020     975 genres ou espèces   dont 805 espèces  (ou sous espèces) 

à ce jour 27/10/2021    1244 genres ou espèces  dont 1046  espèces (ou sous espèces)

https://www.inaturalist.org/observations?d2=2021-10-27&hrank=genus&lrank=subspecies&place_id=any&subview=table&taxon_id=1&user_id=berzou&verifiable=any

coval95

Citation de: Berzou le Octobre 27, 2021, 08:59:19
Pour comptabiliser les espèces stricto sensu de mon jardin j'ai créé un projet sur inaturalist "Un jardin vivant à Sollies toucas"

https://www.inaturalist.org/projects/un-jardin-vivant-a-sollies-toucas

j'y ai observé en 2 ans
999 espèces lato sensu
756 stricto sensu c'est à dire identifiées au niveau de l'espèceau 27 oct 2020  j'avais cumulé 1872 observations dans ce jardin, et identifié 494 espèces animales  (lato sensu  - en incluant les familles sous familles...)

https://www.inaturalist.org/observations?d2=2020-10-27&nelat=43.24020042504075&nelng=6.038097422470656&place_id=any&project_id=un-jardin-vivant-a-sollies-toucas&subview=table&swlat=43.17923457617866&swlng=5.929087467763701&taxon_id=1&verifiable=any&view=species

du 28 octobre 2020 à aujourd'hui 27 octobre 2021 (donc en 1 an jour pour jour) j'ai observé 740 espèces animales en 4530 observations
https://www.inaturalist.org/observations?d1=2020-10-28&d2=2021-10-27&nelat=43.24020042504075&nelng=6.038097422470656&place_id=any&project_id=un-jardin-vivant-a-sollies-toucas&subview=table&swlat=43.17923457617866&swlng=5.929087467763701&taxon_id=1&verifiable=any&view=species

et depuis mon arrivée ici jusqu'à aujourd'hui  889 espèces animales en 6402 observations
Je ne comprends pas comment tu passes de 999 (ou 756 ?) à 889.  ???

Citation de: Berzou le Octobre 27, 2021, 08:59:19
https://www.inaturalist.org/observations?d1=2018-10-31&d2=2021-10-27&nelat=43.24020042504075&nelng=6.038097422470656&place_id=any&project_id=un-jardin-vivant-a-sollies-toucas&subview=table&swlat=43.17923457617866&swlng=5.929087467763701&taxon_id=1&verifiable=any&view=species

et par différence on peut en déduire que la deuxième année, j'ai observé 889 - 494 = 395 espèces animales nouvelles dans ce jardin que je n'avais pas observées la première année
Je ne sais pas comment tu as fait tes requêtes pour 2020 et 2021 mais es-tu bien certain qu'il n'y ait pas de recouvrement entre les deux ? As-tu exclu de 2021 toutes celles qui étaient communes avec 2020 ?

Berzou

Citation de: coval95 le Octobre 27, 2021, 16:50:10
Je ne comprends pas comment tu passes de 999 (ou 756 ?) à 889.  ???
Bonne remarque
Le premier chiffre est celui du tableau de bord projet, fourni par iNaturalist,  il comprends toutes les espèces vivantes,
Le second issu de ma requête, ne compte que les espèces animales. ..
J'aurai du le préciser. ..

Citation de: coval95 le Octobre 27, 2021, 16:50:10

Je ne sais pas comment tu as fait tes requêtes pour 2020 et 2021 mais es-tu bien certain qu'il n'y ait pas de recouvrement entre les deux ? As-tu exclu de 2021 toutes celles qui étaient communes avec 2020 ?
Je pense que oui, j'ai utilisé la même requête,  dans le premier cas jusqu'au 27/10/2020, et dans le second cas, jusqu'au 27/10/2021,  donc les espèces observées seulement la deuxième année incrementent le compteur..
Je n'ai pas trop réfléchi à la façon dont est comptabilisé une sous espèce, mais il ne doit pas y en avoir plus de trois ou quatre...
Ou un sous genre, là aussi quelques cas...

coval95

Citation de: Berzou le Octobre 27, 2021, 23:08:25
...
Je pense que oui, j'ai utilisé la même requête,  dans le premier cas jusqu'au 27/10/2020, et dans le second cas, jusqu'au 27/10/2021,  donc les espèces observées seulement la deuxième année incrementent le compteur..
...
OK mais ça ne marche que si chaque espèce apparaît une seule fois dans la liste globale. On est d'accord ?

Berzou

Citation de: coval95 le Octobre 27, 2021, 23:37:03
OK mais ça ne marche que si chaque espèce apparaît une seule fois dans la liste globale. On est d'accord ?
Oui, la liste globale c'est la classification,  gérée par iNaturalist. ..
Une bestiole peut être observée de nombreuses fois,  le comptage se fait par espèce , selon la classification

Toutes les listes d'observations peuvent être présentées en regroupements selon la classification, d'un clic dans l'en-tête sur le mot espèces. ..

Berzou

Identifier les animaux, c'est bien, mais ça ne suffit pas,

D'abord pour les poĺlinisateurs, puis systématiquement,  j'ai cherché à identifier la plante sur laquelle je les ai observés,

Et de fil en aiguille, j'ai identifié 91 espèces végétales présentes dans mon jardin (pour le moment et avec un degré de précision ou de certitude variable
https://www.inaturalist.org/observations?nelat=43.24020042504075&nelng=6.038097422470656&place_id=any&subview=table&swlat=43.17923457617866&swlng=5.929087467763701&taxon_id=47126&user_id=berzou&verifiable=any&view=species

Et comme le milieu présente aussi un intérêt,  j'ai défini les micro milieux de référence de mon jardin :
Les restanques
Les arbres (chênes, oliviers, figuiers)
Le ciel  (pour les oiseaux en vol)
Les haies (lierre, laurier tin, prunelliers, etc.)
Les pierres sèches du mur de restanque
Le mur crépi de la maison
La maison (pour toutes les intrusions)

Et j'ai associé chaque observation à un milieu,  une plante (sauf les plantes, et si possinle), et un habitat  (pour préciser l'environnement d'observation,  par ex fleur, feuilles, tiges,  mais aussi "sous une pierre" ou sur la terrasse)

Et maintenant ces critères me permettent de classer les observations. ..

Berzou

Je viens de participer à un forum intéressant sur LMDI (accessible aux membres) https://www.insecte.org/forum/viewtopic.php?t=228103
Sur les remontées d'observations dans les bases de données naturalistes et la problématique des doublons
Ou j'ai decrit ma démarche. ..
Du coup j'ai essayé de retrouver mes observations originales, et j'ai constaté avec plaisir que mes observations validées au degré de recherche sur iNaturalist remontent automatiquement et avec les photos dans la base du GBIF.
Je suppose que pour les photos il y a une limite de nombre d'observations.
Mais pour les plus rares ça marche très bien et je trouve que ça valorise bien mes observations
Exemple Neopsocus rhenanus https://www.inaturalist.org/observations/98805286
https://www.gbif.org/species/4398640 Avec mes photos.

Berzou

#22
l'inventaire s'enrichit :

https://www.inaturalist.org/observations?place_id=any&user_id=berzou&verifiable=any

13463 observations, 1925 espèces (au sens large)  vivantes

je vois que mes observations sont reprises dans nombre de projets et passées en revue par de nombreux experts et analysées (interactions) dans bien des cas...

mon projet des "trouvailles" reprends une centaine d'espèces...  https://www.inaturalist.org/projects/finds-trouvailles

mes jardins ont été "exploités à fond", mon actuel jardin compte plus de 1000 espèces vivantes pour plus de 7570 observations https://www.inaturalist.org/projects/un-jardin-vivant-a-sollies-toucas

dont plus de 120 espèces animales directement observées sur les fleurs du lierre de mon jardin
https://www.chassimages.com/forum/index.php/topic,330652.0.html

voici la liste des projets auxquels je contribue sur iNaturalist https://www.inaturalist.org/projects/user/berzou
je suis plutôt content ;) ca avance...

Ca avance même parfois tout seul comme les pseudoscorpions de mon jardin qui viennent de rencontrer un expert capable d'en identifier quelques uns à l'espèce  https://www.inaturalist.org/observations?verifiable=any&taxon_id=172373&locale=fr&user_id=berzou

et en plus il y a de jolies photos voir mon top 10 2023 https://www.chassimages.com/forum/index.php/topic,332338.0.html

Berzou

l'inventaire s'enrichit encore

https://www.inaturalist.org/observations?place_id=any&user_id=berzou&verifiable=any

15494 (+2000)observations, 2152 (+227) espèces (au sens large)  vivantes

mon projet des "trouvailles" reprends 139. espèces...  https://www.inaturalist.org/projects/finds-trouvailles
J'ai apporté à iNaturalist plusieurs espèces nouvelles.

voici la liste des projets auxquels je contribue sur iNaturalist https://www.inaturalist.org/projects/user/berzou
je suis plutôt content ;) ca avance...

Cette année mon meilleur spot a été un citronnier de Kabylie sur lequel j'ai pu observer 176 espèces animales
https://www.inaturalist.org/observations?verifiable=any&place_id=any&field:Associated%20species%20with%20names%20lookup=331124
Mes plus jolies photos de 2023 sont présentées ici
https://www.chassimages.com/forum/index.php/topic,339884.0.html

M@kro

hello

Un ancien essonnien échappé dans le Var, j'espère pouvoir faire de même un jour ^^

Sinon, il existe des suivis temporels en terme scientifique, mais pas pour toutes les espèces d'insectes.
(bcp sont fait pour les papillons diurnes et nocturnes, odonates, mantes, et quelques arthropodes - scorpion, araignées ...)

Mais pas mal de ces études ne sont liées qu'à des "sphères" scientifiques et/ou issues d'études d'impact de bureau d'études.

Après, il peut être utile de renseigner tes observations sur des sites qui remontent les infos au MNHN qui centralisent toutes les données.
Voir plus simplement de demander à des associations naturalistes comment tu peux faire une étude personnelle avec un peu de rigueur scientifique.

Par contre, je ne connais pas absolument pas inaturalist.org, c'est un site basé en Californie, donc peu crédible à mes yeux.
(et surtout qui semble d'ordre privé ET américain donc ne donne aucune garantie sur la notion des données personnelles)
Nikoniste, ex-Pentaxiste